Střevní mikroflóra sehrává zásadní roli v oblasti prevence řady chorob. Jakékoliv narušení bakteriální rovnováhy v jejím množství či složení může vyvolat nežádoucí imunitní reakce nebo zažívací problémy. Probiotika mají protiinfekční účinky, stimulují imunitu, snižují riziko vzniku alergií a příznivě ovlivňují průběh zánětů.
Moderní životní styl je stále více stresující, což může narušovat funkci bakterií v trávicím traktu. Průměrně jeden člověk z pěti trpí nějakou formou zažívacích problémů, ke kterým přispívá i nevhodná strava. Konzumace probiotik tyto problémy odstraňuje nebo pomáhá při jejich prevenci u všech věkových skupin.
Výhodou probiotických kultur jsou nulové vedlejší či nežádoucí účinky, i při náhodném překročení doporučené dávky.
V průběhu lidského života se bakteriální osídlení trávicího traktu mění. Po narození má dítě téměř sterilní trávicí trakt, který se průběžně osídlí v závislosti na stravě. Trvá přibližně dva roky, než se mikroflóra dítěte ustálí.
U starších osob se celkově složení mikroflóry trávicího traktu výrazně mění, dochází ke snižování počtu bakterií Bifidobacterium, v některých případech i zcela vymizí.
Vysoké účinnosti dosahují přípravky obsahující více druhů probiotických bakterií, kde každý druh působí dominantně.
Nejznámějším probiotickým kmenem bakterií je Lactobacillus, který brání přemnožení škodlivých bakterií, a tím udržuje zdravý trávicí trakt.
Bakterie rodu Bifidobacterium tvoří významnou součást bakteriální flóry tlustého střeva.